Много индустрий где фильтры чистой комнаты HEPA играют важную роль в обеспечении очищенности воздуха и исключать потенциальное загрязнение. Промышленные чистые комнаты использованы в медицинском, фармацевтический, еда и напиток, и индустрии полупроводника, среди других, для защиты чувствительных продуктов и процессов от воздушнодесантных инфекций, микроскопических частиц, и других поллютантов.

В больницах, фильтры чистой комнаты HEPA использованы для создания стерильных и безопасных операционных. В пищевых промышленностях фармацевтических и, эти фильтры использованы для поддержания чистой окружающей среды которая свободна от микробного и заражения отравляющим веществом. В индустрии полупроводника, эти фильтры помогают уменьшить пыль и другие частицы для того чтобы исключить любой потенциал для загрязнения на производственной линии.